Структура федеральных органов исполнительной власти утверждена Указом Президента № 649 от 20 мая 2004 г.
Положение о Федеральной службе в сфере здравоохранения утверждено Постановлением Правительства № 323 от 30 июня 2004 г. (ред. от 29 апреля 2013 г.)
Приказом Министерства здравоохранения Российской Федерации от 13 августа 2020 г. № 844н "Об утверждении типового положения о территориальном органе Федеральной службы по надзору в сфере здравоохранения".
Территориальный орган в Республике Бурятия действует на основании Положения о территориальном органе Федеральной службы по надзору в сфере здравоохранения по Республике Бурятия, утвержденного приказом Росздравнадзора от 06.10.2020 № 9135.
Основные полномочия Территориального органа Федеральной службы по надзору в сфере здравоохранения по Республике Бурятия - контроль и надзор в сфере здравоохранения, а также лицензирование медицинской и фармацевтической деятельности и деятельности, по обороту наркотических средств, психотропных веществ и их прекурсоров, культивированию наркосодержащих растений.